2015 год. Ангелы, гигантские боевые машины неизвестного противника вновь появились в Токио. Единственная надежда землян - Евангелионы, боевые мехи, разработанные NERV, специальным международным агентством. Однако пилотировать Евы могут только люди, родившиеся не раньше, чем 14 лет назад, после первого появления Ангелов. Один из таких подростков, Шинджи (Синди) Икари, отец которого возглавляет подразделение NERV, разработавшее и курирующее Евангелионы. Вовлеченный в странные и пугающие события Шинджи узнает многое о себе, своих возможностях и о том, как и почему ему этот мир стал таким, какой он есть...